Nanodcal是一款基于非平衡態(tài)格林函數(shù)-密度泛函理論（NEGF - DFT）的第一性原理計算軟件，主要用于模擬器件材料中的非線性、非平衡的量子輸運過程，是目前國內(nèi)擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的基于第一性原理的輸運軟件?？深A測材料的電流 - 電壓特性、電子透射幾率等眾多輸運性質(zhì)。

迄今為止，Nanodcal 已成功應用于1維、2維、3維材料物性、分子電子器件、自旋電子器件、光電流器件、半導體電子器件設計等重要研究課題中，并將逐步推廣到更廣闊的電子輸運性質(zhì)研究的領域。

5.7. CO/Pd(100)結(jié)構(gòu)優(yōu)化:

5.7.1 研究背景

晶格常數(shù)(Lattice Constant)是晶體物質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)參數(shù)，它與原子間的結(jié)合能有直接的關系。晶格常數(shù)的變化反映了晶體內(nèi)部的成分、受力狀態(tài)等的變化。晶格常數(shù)亦稱為點陣常數(shù)。晶體結(jié)構(gòu)即晶體的微觀結(jié)構(gòu)，是指晶體中實際質(zhì)點（原子、離子或分子）的具體排列情況。而對晶體的結(jié)構(gòu)進行弛豫（優(yōu)化）往往是研究晶體性質(zhì)的最基本的前提，一個結(jié)構(gòu)（晶格參數(shù)，原子位置，對稱性等）是否準確、合理往往能夠決定我們是否能夠得到正確的結(jié)果，在本文中，我們向大家展示Pd(100)_CO的結(jié)構(gòu)弛豫的過程。

5.7.2 Bulk Pd結(jié)構(gòu)弛豫

5.7.2.1 模型搭建

(1)雙擊圖標“Device Studio”快捷方式”打開軟件；

(2)選擇Create a new Project→OK→ 文件名：Pd(100)_CO，保存類型：ProjectFiles(*.hpf)→保存即可；

(3)右擊Pd(100)_CO→New→Crystal，輸入如下坐標。并點擊Build，并命名為Pd；

建立Pd晶體結(jié)構(gòu)界面圖

5.7.2.2 結(jié)構(gòu)弛豫

(1)準備弛豫的輸入文件:Relax.input；基組文件:Pd_LDA_DZP?.nad.

Simulator→Nanodcal→Relax

(2)選中弛豫文件，右擊Run,根據(jù)自己的計算機選擇合適的核數(shù)，進行計算：

提交任務計算界面

(3)計算完成后，得到Atom_relaxed.xyz文件，可在此文件中檢查結(jié)構(gòu)。

5.7.3 Pd(100)切面結(jié)構(gòu)弛豫

5.7.3.1 模型搭建

右擊Pd(100)_CO→New→Crystal，輸入如下坐標。并點擊Build，并命名為Pd(100)；

5.7.3.2 結(jié)構(gòu)弛豫

(1)準備弛豫的輸入文件：Relax.input；基組文件:Pd_LDA_DZP?.nad。Simulator→Nanodcal→Relax。

(2)選中弛豫文件，右擊Run,根據(jù)自己的計算機選擇合適的核數(shù)，進行計算，計算結(jié)束之后產(chǎn)生Atom_relaxed.xyz文件，用于弛豫后的結(jié)構(gòu)檢查。

審核編輯：郭婷