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阿爾茨海默病相關(guān)的基因表達(dá)在不同腦細(xì)胞類(lèi)型中發(fā)生的變化

電子工程師 ? 來(lái)源:ZF ? 2019-05-05 10:36 ? 次閱讀
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北京時(shí)間 5 月 2 日,Nature 雜志發(fā)表了麻省理工學(xué)院(MIT)大腦與認(rèn)知科學(xué)系華人女科學(xué)家蔡立慧(LiHuei Tsai)教授團(tuán)隊(duì)的一項(xiàng)重磅研究,研究人員通過(guò)對(duì) 48 名患有阿爾茨海默?。?a target="_blank">AD)不同程度病理個(gè)體進(jìn)行了超過(guò) 80000 個(gè)單細(xì)胞 RNA 分析,揭示了阿爾茨海默病相關(guān)的基因表達(dá)在不同腦細(xì)胞類(lèi)型中發(fā)生的變化。

這是科學(xué)家們首次對(duì)阿爾茨海默病患者個(gè)體腦細(xì)胞中表達(dá)的基因進(jìn)行綜合分析,并且有望為阿爾茨海默病提供許多潛在的新藥物靶點(diǎn)。

阿爾茨海默病相關(guān)的基因表達(dá)在不同腦細(xì)胞類(lèi)型中發(fā)生的變化

蔡立慧在一份聲明中表示,”我們想知道是否可以區(qū)分每種細(xì)胞類(lèi)型是否在健康和患病的腦組織之間存在差異的基因表達(dá)模式。而這正是單細(xì)胞水平分析的強(qiáng)大能力,我們可以通過(guò)單細(xì)胞分析真正看到大腦中所有不同細(xì)胞類(lèi)型之間的差異?!?/p>

同為研究論文通訊作者的麻省理工學(xué)院計(jì)算機(jī)科學(xué)教授、麻省理工學(xué)院計(jì)算機(jī)科學(xué)與人工智能實(shí)驗(yàn)室成員 Manolis Kellis 表示,”在我看來(lái),這項(xiàng)研究為我們提供了研究阿爾茨海默病患者大腦細(xì)胞所有分子過(guò)程的第一張圖譜,這些過(guò)程在每一種細(xì)胞類(lèi)型中都發(fā)生了改變,而我們現(xiàn)在可以可靠地對(duì)這些細(xì)胞進(jìn)行描述,這開(kāi)啟了一個(gè)了解阿爾茨海默病的全新時(shí)代。”

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)揭示 AD 分子圖譜

細(xì)胞是構(gòu)成生命體的結(jié)構(gòu)和功能的基本單位,不同類(lèi)型的細(xì)胞形態(tài)迥異,功能也各不相同。即使是同類(lèi)細(xì)胞間看似相同,但也存在著廣泛的細(xì)胞異質(zhì)性。早期基于群體細(xì)胞分析所獲得的平均性數(shù)據(jù),往往忽略了細(xì)胞個(gè)體間差異。

隨著細(xì)胞分離和新一代測(cè)序的發(fā)展,研究人員開(kāi)始研究單個(gè)細(xì)胞 DNA、RNA、蛋白質(zhì)和染色質(zhì)層面的差異。2009 年,由北大生命科學(xué)學(xué)院教授湯富酬團(tuán)隊(duì)首次報(bào)道的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),就旨在讓我們?cè)趩渭?xì)胞層面更清楚地識(shí)別特定細(xì)胞及其功能。

使用單細(xì)胞測(cè)序方法,研究人員不僅能夠分析最豐富的細(xì)胞類(lèi)型,包括興奮性和抑制性神經(jīng)元,還能分析稀有的非神經(jīng)元腦細(xì)胞,如少突膠質(zhì)細(xì)胞、星形膠質(zhì)細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞。

圖 | 正常老年人的大腦(左)和阿爾茨海默病患者的大腦(右)比較

之前對(duì)阿爾茨海默病患者基因表達(dá)的研究,已經(jīng)分析了部分腦組織的總體 RNA 水平,但是這些研究沒(méi)有區(qū)分具體的細(xì)胞類(lèi)型,難以揭示豐富細(xì)胞類(lèi)型中發(fā)生的變化。

而在最新的這項(xiàng)研究中,研究人員通過(guò)分析 24 位有著輕度至重度病理學(xué)特征的阿爾茨海默病患者的大腦樣本,以及 24 位幾乎沒(méi)有病理學(xué)特征的對(duì)照組樣本,結(jié)果發(fā)現(xiàn)大腦中的每一種細(xì)胞類(lèi)型在阿爾茨海默病患者中都表現(xiàn)出明顯的基因表達(dá)差異。

一些最顯著的變化發(fā)生在與軸突再生和髓鞘形成相關(guān)的基因中。髓鞘是一種脂肪鞘,它將軸突與外界隔離,幫助軸突傳遞電信號(hào)。研究人員發(fā)現(xiàn),在患有阿爾茨海默病的個(gè)體中,與髓鞘形成相關(guān)的基因在神經(jīng)元和少突膠質(zhì)細(xì)胞(產(chǎn)生髓鞘的細(xì)胞)中都受到影響。

這些細(xì)胞類(lèi)型特異性的基因表達(dá)變化,大多發(fā)生在疾病發(fā)展的早期。在后期階段,研究人員發(fā)現(xiàn)大多數(shù)細(xì)胞類(lèi)型都有非常相似的基因表達(dá)變化模式。具體來(lái)說(shuō),大多數(shù)腦細(xì)胞都發(fā)現(xiàn)了與應(yīng)激反應(yīng)、程序性細(xì)胞死亡以及維持蛋白質(zhì)完整性所需的細(xì)胞機(jī)制相關(guān)的基因。

此外,研究人員還發(fā)現(xiàn)了基因表達(dá)模式與阿爾茨海默病嚴(yán)重程度其他指標(biāo)之間的相關(guān)性,如淀粉樣斑塊和神經(jīng)原纖維纏結(jié)的水平,以及認(rèn)知障礙。

最令人驚訝的是,研究人員發(fā)現(xiàn)了男性和女性阿爾茨海默病患者的腦細(xì)胞之間的巨大差異。研究人員指出,男性患者的興奮性神經(jīng)元和其他腦細(xì)胞在阿爾茨海默病中表現(xiàn)出的基因表達(dá)變化不如女性個(gè)體,即使這些患者確實(shí)表現(xiàn)出相似的癥狀,包括淀粉樣蛋白斑和認(rèn)知障礙。相比之下,來(lái)自女性患者的腦細(xì)胞顯示出阿爾茨海默病中更嚴(yán)重的基因表達(dá)變化,以及一系列改變。

“阿爾茨海默病的性別差異有越來(lái)越多的臨床和臨床前證據(jù),但沒(méi)有潛在的已知機(jī)制。而我們的研究表明,非神經(jīng)元髓鞘細(xì)胞參與的細(xì)胞分化過(guò)程可能發(fā)揮了作用。關(guān)鍵是要弄清楚這些差異是否只在一種性別中保護(hù)或損害腦細(xì)胞,以及如何在另一種性別中平衡預(yù)期方向的反應(yīng)。”研究論文共同第一作者、麻省理工學(xué)院的 Jose Davila--VelderrainJose 說(shuō)。

沒(méi)有參與本項(xiàng)研究的哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)和神經(jīng)學(xué)教授 Bruce Yankner 將這項(xiàng)研究描述為”分子病理學(xué)之旅”。

“這是第一次全面應(yīng)用單細(xì)胞 RNA 測(cè)序技術(shù)研究阿爾茨海默病,”Yankner 說(shuō),”我預(yù)計(jì)這將是該領(lǐng)域非常寶貴的資源,并將促進(jìn)我們對(duì)該疾病的分子基礎(chǔ)的理解?!?/p>

蔡教授發(fā)明的 40 赫茲”光+聲”刺激

阿爾茨海默病作為一種主要與衰老相關(guān)的神經(jīng)退行性疾病,由德國(guó)精神病學(xué)家和病理學(xué)家愛(ài)羅斯·阿爾茨海默在 1906 年首次發(fā)現(xiàn)并命名。至今百余年已經(jīng)過(guò)去,人們?nèi)耘f沒(méi)有成功揭開(kāi)這種疾病的神秘面紗,阿爾茨海默病的藥物研發(fā)也被稱(chēng)為”蒙著眼睛開(kāi)槍”。

數(shù)十年來(lái),各大藥企耗費(fèi)數(shù)十億美元尋找治療阿爾茨海默病的良藥,但結(jié)果并不理想。自 1998 年以來(lái),已有 100 多次嘗試開(kāi)發(fā)治療該疾病的有效藥物,但只有 4 種獲得批準(zhǔn)。這些獲批的藥物,也都只是為了治療一些癥狀,并不能治愈甚至延緩阿爾茨海默病的進(jìn)展。

但即便如此,科學(xué)家們?nèi)栽诓挥噙z力地尋找任何能夠治愈或者延緩阿爾茨海默病的藥物或方法。

2016 年,蔡立慧帶領(lǐng)的研究團(tuán)隊(duì)就曾發(fā)現(xiàn),40赫茲的光能夠刺激小鼠大腦的γ腦電波,減少大腦中的β淀粉樣蛋白。

腦波,是指人腦內(nèi)的神經(jīng)元細(xì)胞之間傳遞信息時(shí)產(chǎn)生的生物電信號(hào)。人類(lèi)的大腦在不同行為及狀態(tài)下可以產(chǎn)生多種腦波,常用的為 β 波、α 波、θ 波、δ 波和 γ 波等。其中 γ 波的頻率為 25~100 赫茲(通常為 40 赫茲),當(dāng)我們集中注意力、做決定或者使用記憶時(shí),主要是這一頻率的腦電波。

以往的研究發(fā)現(xiàn),阿爾茨海默病患者大腦的 γ 波呈現(xiàn)異常,但一直以來(lái),研究者們都將其視為疾病的結(jié)果。而蔡立慧認(rèn)為,如果沒(méi)有足夠的線索,將 γ 波的異常進(jìn)行定性是不足以讓人信服的。也就是說(shuō),如果假設(shè)因?yàn)榛颊叽竽X的 γ 波異常而導(dǎo)致疾病,這種說(shuō)法也是可能的。

基于這一想法,蔡立慧帶領(lǐng)研究團(tuán)隊(duì)首先選擇頻率為 40 赫茲的閃光對(duì)實(shí)驗(yàn)小鼠進(jìn)行光刺激。研究發(fā)現(xiàn),經(jīng)過(guò)每天 1 小時(shí)的處理,小鼠視覺(jué)皮層的 β 淀粉樣蛋白及 Tau 蛋白水平顯著降低。

但光線的作用只能局限在大腦的視覺(jué)皮層,而這與我們更關(guān)注的與記憶相關(guān)的海馬區(qū)還有一定距離。隨后,他們選擇了頻率同為 40 赫茲、受限更少的聲音作為動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的媒介。同樣使實(shí)驗(yàn)動(dòng)物每天暴露在 1 小時(shí)的聲音處理下,7 天后實(shí)驗(yàn)小鼠聽(tīng)覺(jué)皮層和海馬區(qū)中的β淀粉樣蛋白明顯減少,同時(shí)小鼠的認(rèn)知能力增強(qiáng)。

阿爾茨海默病相關(guān)的基因表達(dá)在不同腦細(xì)胞類(lèi)型中發(fā)生的變化

圖 | 40 赫茲”光””聲”刺激改善阿爾茨海默病相關(guān)病理并改善認(rèn)知

之后,研究人員又嘗試了”光+聲音”雙管齊下的試驗(yàn)驗(yàn)證,結(jié)果讓研究團(tuán)隊(duì)喜出望外,二者的結(jié)合發(fā)揮了更大的積極作用,更多的 β 淀粉樣蛋白被清除。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn),行使”免疫吞噬”功能的小膠質(zhì)細(xì)胞的數(shù)量增加,并且大腦內(nèi)的血管直徑也有所增大,而這很可能是大腦清除 β 淀粉樣蛋白的重要途徑。

這一研究成果也于 2019 年 3 月發(fā)表在 Cell雜志。不久前在接受 DeepTech 采訪時(shí)蔡立慧表示,這種療法對(duì)于阿爾茨海默病而言,可以說(shuō)是一種”減緩”,但目前并沒(méi)有足夠的證據(jù)證明這種療法可以”逆轉(zhuǎn)”疾病。她表示,其團(tuán)隊(duì)剛剛開(kāi)始人體研究,希望測(cè)試該療法在早期阿爾茨海默病患者身上的效果。

在阿爾茲海默病藥物研發(fā)領(lǐng)域跌入冰點(diǎn)的這兩年,不得不說(shuō)類(lèi)似于”光+聲”刺激治療阿爾茨海默病的新療法,給全球數(shù)以億計(jì)的阿爾茨海默病患者帶來(lái)了新的希望。而隨著科學(xué)家們?cè)趩渭?xì)胞水平對(duì)于阿爾茲海默病的全新認(rèn)識(shí),新的靶點(diǎn)和藥物研發(fā)也將隨之而來(lái)。

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原文標(biāo)題:MIT華人女科學(xué)家揭示AD單細(xì)胞分子圖譜,開(kāi)啟阿爾茨海默認(rèn)知全新時(shí)代

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